組培凈化車間設計原則為：
◆ 防止污染，控制住污染，就等于組織培養成功了一半；
◆ 結構和布局合理，工作方便、節能、安全；
◆ 按照工藝流程科學設計、經濟、實用和高效。 組培凈化車間選址要求避開污染源，例如最好避免與溫室、微生物實驗室、昆蟲實驗室相鄰，水電供應應充足，交通運輸便利。
◆ 組培凈化車間建造時，應采用產灰塵量最少的建筑材料；
◆ 墻壁、天花板、地面的交界宜做成弧形，便于日常清潔；
◆ 洗手池、下水道的位置要適宜，不得對培養環境造成污染，下水道開口位置應對組培車間的潔凈度影響最小，并有避免污染的措施；
◆ 設置防止昆蟲、鳥類、鼠類等動物進入的措施；
◆ 管道要盡量暗裝，安排好暗敷管道的走向，便于日后的維修并能確保在維修時不造成污染。
◆ 接種室、培養室的裝修材料必須經得起消毒、清潔和沖洗，并設置能確保與其潔凈度相應的控溫控濕的設施；
◆ 組培車間的電源應由專業部門設計、安裝并經驗證合格之后方可使用，應有備用電源，確保停電或掉電時能繼續操作。

食用菌凈化車間注意事項：
★ 安全注意事項 嚴格無菌操作，防止微生物污染；操作人員進入無菌室應先關掉紫外燈。
★ 無菌室應設有無菌操作間和緩沖間，無菌操作間潔凈度應達到10000級，室內溫度保持在20-24℃，濕度保持在45-60%。超凈臺潔凈度應達到100級。
★ 無菌室應保持清潔，嚴禁堆放雜物，以防污染。嚴防一切滅菌器材和培養基污染，已污染者應停止使用。
★ 無菌室應定期用適宜的消毒液滅菌清潔，以保證無菌室的潔凈度符合要求。
★ 需要帶入無菌室使用的儀器，器械，平皿等一切物品，均應包扎嚴密，并應經過適宜的方法滅菌。
★ 工作人員進入無菌室前，必須用肥皂或消毒液洗手消毒，然后在緩沖間更換專用工作服，鞋，帽子，口罩和手套(或用70%的乙醇再次擦拭雙手)，方可進入無菌室進行操作。
★ 無菌室使用前必須打開無菌室的紫外燈輻照滅菌30分鐘以上，并且同時打開超凈臺進行吹風。操作完畢，應及時清理無菌室，再用紫外燈輻照滅菌20分鐘。
★ 供試品在檢查前，應保持外包裝完整，不得開啟，以防污染。檢查前，用70％的酒精棉球消毒外表面。
★ 凡帶有活菌的物品，必須經消毒后，才能在水龍頭下沖洗，嚴禁污染下水道。

部分食品、涂裝凈化案例